Published 1999 | Version v1
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Localisation of the ribosomal proteins L2, L14 and L24 of the E. coli ribosome by means of nuclear spin contrast variation

  • 1. GKSS-Forschungszentrum Geesthacht GmbH (Germany). Inst. fuer Werkstofforschung

Description

Ribosomes are ribonucleo-protein complexes, which are the site of the protein synthesis, one of the most important steps during the translation of the genetic code from the DNA to the proteins. The proteins L2, L14 and L24 in the 50S subunit and the protein L2 in the 70S ribosome of the E. coli bacterium were localised by means of nuclear spin contrast variation. The contrast created by isotopic substitution is increased by almost a factor of three provided that polarised neutrons are scattered by polarised hydrogen spins of the sample. To get additional information about the in situ structure of the proteins the shapes were described by a two or three sphere model. Within the project of mapping the 50S subunit of the E. coli ribosome the protein L24 is localised for the first time. L24 is one of the initiator protein for the assembly of the 50S subunit therefore the knowledge of the position is of great interest for the understanding of this process. With the localisation of the protein L14, which is one of the most conserved protein in the ribosome, new hints are given in respect of the protein function which was until now unknown. The localisation of the protein L2, which is one of the candidates of the area of the central step in protein synthesis was done both in the 50S subunit and in the whole 70S ribosome. This allows to investigate conformational changes during the association of the subunits. (orig.)

Availability note (English)

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Abstract (German)

Ribosomen sind Ribonukleinsaeure-Protein-Komplexe, die in allen lebenden Organismen die Proteinsynthese durchfuehren, einen der zentralen Schritte bei der Umsetzung der genetischen Information von der DNA zu den Proteinen. Im Rahmen dieser Arbeit wurden die Proteine L2, L14 und L24 in der 50S-Untereinheit und des Proteins L2 im 70S-Ribosom des E. coli-Bakteriums mit Hilfe der Kernspinkontrastvariation lokalisiert. Grundlage dieser Methode ist ein durch Isotopensubstitution erzeugter Kontrast, der durch die Streuung von polarisierten Neutronen an polarisierten Wasserstoffspins der Probe bis zu einem Faktor von drei noch verstaerkt wird. Um zusaetzliche Informationen ueber die In situ-Form der Proteine zu erhalten, wurde bei der Positionsbestimmung neben dem bislang verwendeten Einkugelmodell die Form des Labels durch Zwei- bzw. Dreikugelmodelle angenaehert. Im Rahmen der Kartografierung der 50S-Untereinheit des E. coli-Ribosoms ist es erstmalig gelungen, das Protein L24 zu lokalisieren. Die Kenntnis seiner Position ist fuer das Verstaendnis des Aufbauvorgangs der 50S-Untereinheit von grossem Interesse, da es sich um eines der Initiatorproteine dieses Prozesses handelt. Mit der Lokalisation des Proteins L14, eines der am besten konservierten Proteine im Ribosom ueberhaupt, ergeben sich neue Ansatzpunkte zur Erklaerung seiner bislang unbekannten Funktion. Die Lokalisation des Proteins L2, einem Kandidaten fuer den zentralen Schritt der Proteinsynthese sowohl in der 50S-Untereinheit als auch erstmalig im gesamten 70S-Ribosom, gibt zusaetzlich die Moeglichkeit, um Konformationsaenderungen bei der Assoziation der Untereinheiten festzustellen. (orig.)

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Original title (German)
Lokalisation der ribosomalen Proteine L2, L14 und L24 des E. coli-Ribosoms mit Hilfe der Kernspinkontrastvariation

Publishing Information

Imprint Pagination
140 p.
ISSN
0344-9629
Report number
GKSS--99/E/37

INIS

Country of Publication
Germany
Country of Input or Organization
Germany
INIS RN
31047433
Subject category
S60: APPLIED LIFE SCIENCES;
Resource subtype / Literary indicator
Thesis
Descriptors DEI
CONTRAST MEDIA; ESCHERICHIA COLI; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTEINS; RIBOSOMES
Descriptors DEC
BACTERIA; CELL CONSTITUENTS; MAGNETIC RESONANCE; MICROORGANISMS; ORGANIC COMPOUNDS; RESONANCE