Electrophoretic mobility of PM2 DNA treated with ultimate chemical carcinogens or with ultraviolet light
Creators
- 1. Deutsches Krebsforschungszentrum, Heidelberg (Germany, F.R.). Inst. fuer Biochemie
Description
Superhelical DNA of the Pseudomonas phage PM2 was irradiated with UV-light or reacted with covalently binding carcinogens, such as 7-bromomethyl-benz[a]anthracene, (Ac)2ONFln, K-region epoxides, and alkylating agents. Migration velocity of the DNA products was determined using agarose gel electrophoresis. In gels of more than 1.3%-1.9% agarose, modified PM2 DNA exhibited a dose-(concentration-)dependent decrease of migration velocity. This phenomenon is probably due to a decrease in superhelix density which caused the compact DNA coil to assume eventually an open-circular conformation. Comparison of the extent of DNA modification with the decrease of migration velocity revealed that the superhelical structure sensitively reflected the chemical DNA alterations. DNA species exhibiting in 1.6% agarose gels, a migration velocity of up to 30% of that of control DNA showed an increase of velocity in 0.4% agarose. Therefore, in 1.3%-1.9% agarose gels, the decrease of superhelix density is accompanied by an increase of the frictional coefficient, whereas in 0.4%-0.9% agarose gels the same decrease of superhelix density apparently led to a higher degree of flexibility of the macromolecule and/or exposure of additional electric charges. (orig.)
Abstract (German)
Die superhelikale DNA des Pseudomonas Phagen PM2 wurde mit Ultraviolettlicht bestrahlt oder mit kovalent bindenden Carcinogenen wie 7-Brommethyl-bens[a]anthrazen. (Ac)2ONFln, K-Region Expoxiden und Alkylantien umgesetzt. Mittels Gelelktrophorese wurde die Wanderungsgeschwindigkeit der DNA-Produkte bestimmt. In Trenngelen mit einem Agarosegehalt von 1,3-1,9% nahm die Wanderungsgeschwindigkeit der DNA mit steigender Modifikationsdichte (steigenden Carcinogen-Konzentrationen bzw. UV-Dosen) ab. Dieses Phaenomen ist wahrscheinlich darauf zurueckzufuehren, dass die DNA-Modifikation eine Abnahme der Superhelix-Dichte bewirkte, im Zuge derer das urspruenglich kompakte, geknaeuelte DNA-Molekuel schliesslich eine offen-zirkulaere Konformation annahm. Ein Vergleich der DNA-Modifikationsdichte mit der damit verbundenen Abnahme der Wanderungsgeschwindigkeit machte deutlich, dass der Grad der Superhelizitaet sehr empfindlich mit den chemischen DNA-Veraenderungen variierte. DNA-Proben, die in 1,6%igen Agarosegelen eine Wanderungsverzoegerung bis zu 70% der Kontroll-DNA zeigten, liefen in 0,4%igen Trenngelen merkwuerdigerweise schneller als die Kontrollen. Somit ist in Trenngelen von einem 1,3-1,9%igen Agarosegehalt die Abnahme der Superhelix-Dichte von einer Zunahme des Reibungskoeffizienten begleitet; dagegen scheint in 0,4-0,9%igen Agarosegelen dieselbe Abnahme der Superhelix-Dichte zu einer hoeheren Flexibilitaet des Makromolekuels und/oder der Freisetzung zusaetzlicher elektrischer Ladungen zu fuehren. (orig.)Additional details
Additional titles
- Original title (German)
- Elektrophoretische Beweglichkeit von PM2 DNA nach Umsetzung mit direkt wirkenden chemischen Carcinogenen oder nach Bestrahlung mit ultraviolettem Licht
Publishing Information
- Journal Title
- J. Cancer Res. Clin. Oncol.
- Journal Volume
- 96
- Journal Issue
- 3
- Series
- J. Cancer Res. Clin. Oncol.
- Journal Page Range
- 243-257
- ISSN
- 0171-5216
INIS
- Country of Publication
- Germany
- Country of Input or Organization
- Germany
- INIS RN
- 12577576
- Subject category
- S63: RADIATION, THERMAL, AND OTHER ENVIRONMENTAL POLLUTANT EFFECTS ON LIVING ORGANISMS AND BIOLOGICAL MATERIALS;
- Descriptors DEI
- BACTERIOPHAGES; CARCINOGENS; DNA; GENETIC RADIATION EFFECTS; RESPONSE MODIFYING FACTORS; ULTRAVIOLET RADIATION
- Descriptors DEC
- BIOLOGICAL EFFECTS; BIOLOGICAL RADIATION EFFECTS; ELECTROMAGNETIC RADIATION; GENETIC EFFECTS; MICROORGANISMS; NUCLEIC ACIDS; ORGANIC COMPOUNDS; PARASITES; RADIATION EFFECTS; RADIATIONS; VIRUSES