Les phenomenes d'accretion et d'ejection se retrouvent au sein d'une grande diversite d'objets astrophysiques: des etoiles en formation jusqu'aux noyaux actifs de galaxies (AGNs). Les microquasars sont composes d'un objet compact de masse stellaire, accretant la matiere d'une etoile compagnon et partageant de nombreuses proprietes avec les AGNs. Ils representent des environnements ideaux pour l'etude du couplage accretion/ejection du fait de la proximite des systemes, des niveaux de luminosite atteints et des temps caracteristiques d'evolution relativement courts. Leur emission gamma de haute energie (HE) demeure cependant peu contrainte. Nous nous attachons ici a caracteriser ce rayonnement avec le telescope spatial Fermi/LAT dans les microquasars et tentons de le mettre en evidence pour d'autres classes de binaires afin de determiner les conditions necessaires a la production d'une telle emission. Le satellite Fermi surveille continument le ciel gamma et est ideal pour l'etude des phenomenes transitoires. Nous avons notamment recherche une emission HE a la suite d'une eruption stellaire exceptionnelle de l'etoile double DG CVn, cependant, l'exces HE eventuellement repere semble associe a l'activite d'un AGN en arriere plan. Nous nous sommes egalement interesses a la variable cataclysmique SS Cyg dont les sursauts periodiques sont associes a la formation de jets relativistes. Apres 26 ans de quiescence, le microquasar V404 Cyg de faible masse s'est reveille lors d'une eruption spectaculaire. Les etudes avec Fermi/LAT que nous avons dirigees ont conduit pour la premiere fois a la detection de V404 Cyg en rayons gamma HE. Les observations radio effectuees avec le VLA de V404 Cyg, alors en quiescence, nous permettent de devoiler la variabilite du jet a courte echelle temporelle ainsi que le maintien du couplage accretion/ejection a basse luminosite. Pour finir, nous detaillons les resultats d'une campagne d'observations simultanees radio/rayons X du candidat trou noir GRS 1739-278. Des transitions d'etat a faible luminosite sont observees lors de deux courts sursauts successifs, rarement mis en evidence dans les microquasars. Nous discutons l'origine physique de ce comportement en contraste avec ses precedentes eruptions.