L'objectif de cette these est le developpement de nouvelles methodes d'analyse et de commande pour une classe d'equations aux derivees partielles couplees permettant de modeliser le transport combine du flux magnetique et de la pression (produit de la densite et de la temperature) dans les plasmas tokamak. Le systeme couple est represente par deux equations 1D de diffusion resistive. Dans cette these, on a obtenu deux types de modeles: le premier repose sur des principes physiques et le second exploite les donnees obtenues en utilisant des techniques d'identification des systemes. La conception de commande est basee sur l'etude en dimension infinie en utilisant l'analyse de Lyapunov. Le controle composite est synthetise en utilisant la theorie des perturbations singulieres pour isoler la composante rapide de la composante lente. Tout le travail theorique est implemente et teste dans des simulations basees sur la physique avancee en utilisant le simulateur de plasma pour les tokamaks DIII-D, ITER et TCV. (auteur)