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AbstractAbstract
[en] In the field of radiobiology, damage to nuclear DNA is extensively studied since it is considered as a sensitive target inside cells. Mitochondria are starting to get some attention as sensitive targets as well since they control many functions important to the cell's survival. They are double membraned organelles mainly in charge of energy production as well as reactive oxygen species regulation, cell signaling and apoptosis control. Some experiments have shown that after exposure to ionizing radiation the mitochondrial contents are altered and their functions are affected. That is why we are interested in studying the effects of ionizing radiation on mitochondria. At the microscopic scale, Monte Carlo simulations are helpful in reproducing the tracks of ionizing particles for a close study. Therefore, we produced 3D phantoms of mitochondria starting from microscopic images of fibroblast cells. These phantoms are easily uploaded into Geant4 as tessellated and tetrahedral meshes filled with water representing the realistic geometry of these organelles. Microdosimetric analysis is performed to deposited energy by 250 keV photons inside these phantoms. The Geant4-DNA electromagnetic processes are used to simulate the tracking of the produced secondary electrons. Since clustered damages are harder to repair by cells, a clustering algorithm is used to study the spatial clustering of potential radiation damages. In radiotherapy, it is a challenge to deliver an efficient dose to the tumor sites without affecting healthy surrounding tissues. The use of gold nanoparticles as radio-sensitizers seems to be promising. Their high photon absorption coefficient compared to tissues deposit a larger dose when they are preferentially absorbed in tumors. Since gold has a high atomic number, Auger electrons are produced abundantly. These electrons have lower range than photoelectrons enabling them to deposit most of their energy near the nanoparticle and thus increasing the local dose. We studied the radio-sensitizing effect of gold nanoparticles on the mitochondria phantom. The effectiveness of this method is dependent on the number, size and spatial distribution of gold nanoparticles. After exposure to ionizing radiation, reactive oxygen species are produced in the biological material that contains abundant amount of water. In this study, we simulate the chemical species produced inside the mitochondria phantom and their clustering is estimated. We take advantage of the Geant4-DNA chemistry processes libraries that is recently included in the Geant4.10.1 release to simulate the spatial distribution of the chemicals and their evolution with time. (author)
[fr]
Dans le domaine de la radiobiologie, les dommages causes a l'ADN nucleaire sont largement etudies puisque l'ADN est considere la cible la plus sensible dans la cellule. En plus de l'ADN, les mitochondries commencent a attirer l'attention comme des cibles sensibles, car elles controlent de nombreuses fonctions importantes pour la survie de la cellule. Ce sont des organites a double membranes principalement chargees de la production d'energie ainsi que la regulation reactive des especes d'oxygene, la signalisation cellulaire et le controle de l'apoptose. Certaines experiences ont montre qu'apres exposition aux rayonnements ionisants, les teneurs mitochondriales sont modifiees et leurs fonctions sont affectees. C'est pourquoi nous sommes interesses par l'etude des effets des rayonnements ionisants sur les mitochondries. A l'echelle microscopique, les simulations Monte-Carlo sont utiles pour reproduire les traces de particules ionisantes pour une etude approfondie. Par consequent, nous avons produit des fantomes 3D de mitochondries a partir d'images microscopiques de cellules fibroblastiques. Ces fantomes ont ete transformes de facon a etre telecharges dans Geant4 sous forme de mailles tesselisees et tetraedriques remplies d'eau representant la geometrie realiste de ces organites. Les simulations numeriques ont ete effectuees afin de calculer les depots d'energie induits par des photons de 250 keV a l'interieur de ces fantomes. Les processus electromagnetiques Geant4-DNA sont utilises pour simuler les traces des electrons secondaires produits. Etant donne que les dommages groupes sont plus difficiles a reparer par les cellules, un algorithme specifique est utilise pour etudier le regroupement spatial des degats potentiels des rayonnements. En radiotherapie, il est difficile de donner une dose efficace aux sites de la tumeur sans affecter les tissus environnants sains. L'utilisation de nanoparticules d'or comme radio-sensibilisateurs semble etre prometteuse. Leur coefficient d'absorption eleve augmente la probabilite d'interaction des photons et induit une dose tumorale plus importante lorsque ces particules sont absorbes de maniere preferentielle dans les tumeurs. Puisque l'or a un nombre atomique eleve, les electrons Auger sont produits en abondance. Ces electrons ont une portee plus faible que les photoelectrons, ce qui leur permet de deposer la majeure partie de leur energie pres de la nanoparticule, ce qui augmente la dose locale. Nous avons etudie l'effet radio-sensibilisant des nanoparticules d'or sur le fantome des mitochondries. L'efficacite de cette methode depend du nombre, de la taille et de la repartition spatiale des nanoparticules d'or. Apres exposition aux rayonnements ionisants, des especes reactives d'oxygene sont produites dans le milieu biologique qui contient une quantite d'eau abondante. Dans cette etude, nous simulons les especes chimiques produites a l'interieur du fantome des mitochondries et leur regroupement est estime. La distribution spatiale des produits chimiques et leur evolution avec le temps et par la suite analysee au moyen d'algorithme specifique de traitement de donnees. (auteur)Original Title
Simulations Monte Carlo des effets des photons de 250 keV sur un fantome 3D realiste de mitochondrie et evaluation des effets des nanoparticules d'or sur les caracteristiques des irradiations
Primary Subject
Secondary Subject
Source
29 Sep 2017; 169 p; 194 refs.; Available from the INIS Liaison Officer for France, see the INIS website for current contact and E-mail addresses; These Docteur d'Universite, Specialite: Physique
Record Type
Miscellaneous
Literature Type
Thesis/Dissertation
Report Number
Country of publication
ABSORPTION, ANIMAL CELLS, BIOLOGICAL EFFECTS, BOSONS, CALCULATION METHODS, CELL CONSTITUENTS, COMPUTER CODES, CONNECTIVE TISSUE CELLS, DISTRIBUTION, DRUGS, ELEMENTARY PARTICLES, ELEMENTS, EMISSION, ENERGY RANGE, KEV RANGE, MASSLESS PARTICLES, MATHEMATICAL LOGIC, METALS, MOCKUP, PARTICLES, RADIATION EFFECTS, RESPONSE MODIFYING FACTORS, SIMULATION, SOMATIC CELLS, SORPTION, STRUCTURAL MODELS, TRANSITION ELEMENTS
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