Le microcebe murin (Microcebus murinus) est un primate attirant l'attention de la recherche neuroscientifique. Son anatomie cerebrale est encore mal decrite et ses reseaux cerebraux n'ont jamais ete etudies. Le premier objectif de cette these etait de developper de nouveaux outils menant a la creation d'un atlas numerique 3D du cerveau du microcebe. Cet atlas est un outil fondamental car pouvant etre utilise pour extraire automatiquement des biomarqueurs cerebraux de diverses neuropathologies. Par la suite, nous avons mis en place des protocoles IRM et informatiques pour analyser la connectivite neuronale du microcebe murin. Nous avons evalue pour la premiere fois les reseaux cerebraux de cet animal et revele que son cerveau est organise en regions fonctionnelles integrees dans des reseaux fonctionnels a plus grande echelle. Ces reseaux ont ete classes et compares a des reseaux similaires chez l'homme. Cette comparaison multi-especes a mis en evidence des regles d'organisation communes mais aussi des divergences. L'imagerie du glutamate par transfert de saturation et par echange chimique (gluCEST) est une methode permettant de creer des cartes 3D de la distribution du glutamate. Dans une troisieme etude, nous avons compare l'activite neuronale locale, la connectivite fonctionnelle et le contraste gluCEST dans diverses regions du cerveau. Nous avons ainsi mis en evidence differentes associations entre ces trois biomarqueurs. Enfin, l'impact du vieillissement sur la connectivite fonctionnelle, l'activite neuronale locale et le contraste gluCEST a ete evalue en comparant deux cohortes de microcebes murins