Le probleme du conditionnement de processus de Markov homogenes en temps sur une uctuation rare a ete etudie dans le cadre de la theorie des grandes deviations. Sur cette base, un nouveau processus equivalent au processus conditionne a ete introduit en utilisant la transformee de Doob generalisee: il s'agit du 'processus drive'. Dans cette these, on ambitionne de generaliser ces resultats a une classe plus large de processus de Markov. Dans la premiere partie de ce manuscrit, on considere des processus de Markov conduits periodiquement, caracterises par des generateurs periodiques. On veut conditionner ces processus sur des observables denies via des fonctions periodiques en temps. En adaptant les resultats du cas homogene en temps, on construit le processus drive pour lequel les valeurs typiques de nos observables apres un grand nombre de periodes correspondent aux valeurs utilisees pour le conditionnement. Dans le cas periodique, les generateurs independants du temps deviennent periodiques, les exponentielles de matrices deviennent des exponentielles ordonnees en temps et les problemes spectraux deviennent des equations dierentielles du premier ordre. Le processus drive s'obtient soit en utilisant l'equivalence de probabilites de chemin, soit a partir d'un probleme d'optimisation de fonctions de grandes deviations. Dans la deuxieme partie de ce manuscrit, nous etendons ces resultats au cas general des processus de Markov non lineaires decrits par des lagrangiens et des hamiltoniens independants du temps. Dans ce nouveau formalisme, la transformee de Doob generalisee menant vers le processus drive se traduit par une transformation canonique sur les hamiltoniens. Cette transformation que l'on appellera 'rectification' necessite d'etudier l'analogue non lineaire du theoreme de Perron-Frobenius. Cette etude nous a conduits a conjecturer une classication des solutions d'une equation de Hamilton-Jacobi. Nous concluons cette partie par une ouverture sur le probleme du conditionnement des processus non lineaires conduits periodiquement. (auteur)